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编制的方式很简单：每一百个人编为一队，找一名降将作为队长，分一面军旗给他，就算一个基本单位。至于这个百人队内部如何管理，则由队长自行决定——其中大部分仍是按明军惯例，五十人设一总旗，十人设一小旗。
只是这些百人队的组成*人员却并非按照原来百户所人员编制，而是从整个一万多人中随机抽取，不管原来是什么亲朋好友关系，这时候全部打散重编，从而在最大限度上避免串连的可能性，这样作为一个整体的队伍，其行动就只会服从上面的命令。
其次就是对这一百多名百人队长实施平行管理——这些百人队长相互之间地位都是平等的，哪怕昨天出面劝降的马骢等人也是一样，不存在谁命令谁的问题。如果有任务需要两支以上的百人队去执行，则由琼海军派出的军官临时指定一位首领，但任务结束后其权力便自动丧失。这样安排的缺点是损失了效率，不过反正他们现在也并不要求效率，只要安稳就好。
这些人员在被重新整编之后立即就投入到繁重工作中去——按照北纬他们的治军经验，要防止士兵捣蛋闹事，最好办法便是让他们精疲力竭。眼下登州府刚刚收复，城里犹自混乱不堪，城外则还有昨天战场没有收拾，到处都是一片狼藉，这现成的一万多劳动力正好被利用起来。
在岸上局势稳定下来之后，石亦生林峰等“文职人员”都先后登陆上来，郑芝虎也兴冲冲带着一千步军过来凑热闹——他们昨晚虽然被允许进入水城。但当时天色已晚，他们郑家军执行的明军制度，天黑以后就不允许离营乱闯了，除非是冲到城里去放火抢劫。
由北纬所控制的水城当然不会允许他们放肆，于是郑家人只好胡乱在小海岸边窝了一夜，天亮以后便赶紧出来寻找立功机会。可是跑出来一看……什么？登州已下，叛军全部投降了？郑芝虎的脸色当时就有点发青——他还想着进城去捞一把呢。
好在这边很快调拨给他一个满意差事——让他率部监督三千降军打扫城外战场。这活儿在旁人看来既肮脏又辛苦，但郑家人干起来却是兴高采烈，因为琼海军这边答应把所有敌军的首级统统送给他们。
大明朝历来以首级记军功，一颗敌人的脑袋就意味着若干白银。曾经是北边敌人的脑袋最贵，一颗脑袋就能换二十两纹银，东北次之，西蕃蛮夷再次，内地叛军垫底——叛军首级原先是不怎么值钱的，但随着孔有德几次三番击溃朝廷军队，又把莱州府给围了个水泄不通，到如今这价目总算也涨上去了。加上他们福建军队是远道而来，客军在记功时要翻倍，这里的几千颗脑袋若都能报上去，倒也抵得上十数万两银子。
