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当然，这个重组或者撤销的过程需要三个基本条件：指挥、能量、材料。
可编程原子不能自己构建物体，所以需要指挥中枢，这就是为了ai核心必须要在线它才能发挥作用的根本原因。而新星号的ai其实就是那八个龙族个体，所以只要他们八个之中有一个人还活着，这个功能就可以继续生效。当然，人数下降的时候恢复速度会变慢，因为这个需要一定的计算力支持，人少了运算速度下降自然就会导致恢复速度下降。
能量的部分当然也是必须的。转化物质结构需要能量支持，而这个能量却不一定是飞船的自身动力提供。事实上可编程原子具有将分子振动能量转化为动力能量的能力，也就是说理论上可编程原子可以在绝对零度之外的温度状态下吸收环境热能用于自我修复，当然环境温度的高低直接影响吸收速度。如果飞船正好在一枚恒星附近，那这个修复速度可能会非常快。当然，也不是说能量多就一定可以瞬间修复。毕竟计算力和可编程原子地自我再生速度也有影响。
除了计算力和能量支持，材料也是一个关键因素。可编程原子不可能无中生有的产生物质，所以它需要材料。但是。因为已经可以进行原子级别的重组，所以可编程原子理论上可以组成任何化合物结构。但是却无法改变原子结构。也就是说，可编程原子无法用铁原子合成黄金，但只要再提供别的辅助原子，它就可以组成任何一种合金结构。
因为这种特点，可编程原子修复船体需要转换一定量的外界物质。当然，新星号因为有这种功能，所以会额外带上一些材料作为备用，但是如果备用材料耗尽。也不是说就没办法了。可编程原子其实可以分解任何物质，只要停在某个星球表面，或者小行星，它们就可以像是行军蚁蚕食大型生物一样分解掉星体表面的物质并选出有用的元素加以转化。
只要以上三点条件都能正常运作，那么新星号就可以无限再生，不管损伤程度多高都一样。而且损伤越小，修复越快。
目前新星号内部的八个龙族成员都在，能量也算够用，而且穿体内的备用修复物质还没有用完，所以修复速度相当快。这一路打过来也不过就不到半小时而已，那个洞口就已经只剩下一个可以过私家车的小洞了。算上洞口变小之后恢复加快的部分，剩下的部分应该可以在十几分钟之内完全恢复。
当然。新恢复的位置强度会比别的地方弱一点。倒不是恢复材料的问题，而是因为修补原理的问题。可编程原子在修复过程中会先编织出类似金属网一样的东西，然后编织第二层网格，逐渐向前堆积，最后组成分子级的网孔结构封堵漏洞修复原有结构。在这个网眼结构完成后，功能其实就已经基本恢复了，而且肉眼看不出任何的问题。但这个时候材料本身内部其实全都是洞，所以结构强度其实达不到原先的标准，但至少能用了。
